המרכז לניהול עמותות מקיים באופן קבוע סדנאות מנהלים והרצאות בנושאים שונים הקשורים לניהול העמותה. הסדנאות מעניקות ידע נרחב ומגוון אשר מסייע לחברי ועדות ומנהלי עמותה להתמודד עם תחרות קשה של מלכ"רים, לגייס כספים ולבנות אסטרטגייה שיווקית, לנהל תקשורת יעילה עם המערכת הבנקאית, להכיר את החוקים והתקנות הקשורים לעמותות ולהפוך את העמותה לארגון יעיל ואפקטיבי מניב רווחים. בנוסף לחומר התיאורטי הסדנאות שמות דגש מיוחד על תרגול מעשי והתנסות במצבים השונים המדמים את העולם האמיתי של ניהול עמותה.
